物性研システムC(kugui)でLAMMPS。
mkdir github
cd github
git clone -b stable --depth=1 https://github.com/lammps/lammps.git
cd lammps
cd src
qsub -I -V -q i2cpu -l select=1:ncpus=2
module load intel intel-mpi
make mpi CC=mpiicc LINK=mpiicc CCFLAGS="-g -O3 -std=c++11 -qopenmp" LINKFLAGS="-g -O3 -std=c++11 -qopenmp" -j 20
基本的にコンパイラとリンカにmpiiccを指定するだけだが、module loadするのと、コンパイルオプションだけでなく、リンクオプションにも-qopenmpが必要なのがポイント。
WindowsでPDFをプレビューする時、Adobe Readerが自動再読み込みに対応していないため、WSLでevniceで開いているのが、なんともアホっぽい。
塩漬け論文、子供が寝てから気合で返事をかきあげた。10年近く寝かせた論文。とにかくpublishまでこぎつけなければ。